Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms