Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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