Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP1P09874 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP1P09874 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP1P09874 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP1P09874 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP1P09874 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP1P09874 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP1P09874 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP1P09874 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP1P09874 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP1P09874 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP1P09874 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP1P09874 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP1P09874 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP1P09874 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP1P09874 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP1P09874 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP1P09874 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP1P09874 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP1P09874 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP1P09874 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP1P09874 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP1P09874 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP1P09874 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP1P09874 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP1P09874 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PARP1P09874 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP1P09874 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP1P09874 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP1P09874 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP1P09874 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP1P09874 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP1P09874 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP1P09874 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP1P09874 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP1P09874 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP1P09874 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP1P09874 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP1P09874 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP1P09874 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP1P09874 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP1P09874 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP1P09874 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP1P09874 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms