Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB1P08034 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB1P08034 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB1P08034 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB1P08034 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB1P08034 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB1P08034 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB1P08034 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB1P08034 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB1P08034 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB1P08034 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB1P08034 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB1P08034 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB1P08034 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB1P08034 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB1P08034 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB1P08034 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB1P08034 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB1P08034 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB1P08034 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB1P08034 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB1P08034 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB1P08034 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB1P08034 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB1P08034 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB1P08034 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB1P08034 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB1P08034 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB1P08034 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB1P08034 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB1P08034 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB1P08034 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB1P08034 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB1P08034 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB1P08034 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB1P08034 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB1P08034 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB1P08034 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB1P08034 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB1P08034 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB1P08034 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB1P08034 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB1P08034 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB1P08034 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB1P08034 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB1P08034 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GJB1P08034 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GJB1P08034 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB1P08034 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB1P08034 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB1P08034 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB1P08034 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB1P08034 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB1P08034 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB1P08034 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB1P08034 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB1P08034 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB1P08034 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB1P08034 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB1P08034 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB1P08034 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB1P08034 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB1P08034 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB1P08034 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB1P08034 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB1P08034 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB1P08034 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB1P08034 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB1P08034 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB1P08034 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB1P08034 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB1P08034 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB1P08034 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB1P08034 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB1P08034 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB1P08034 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB1P08034 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB1P08034 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB1P08034 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB1P08034 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB1P08034 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms