Protein–RNA interactions for Protein: P05386

RPLP1, 60S acidic ribosomal protein P1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP1P05386 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPLP1P05386 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms