Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A1P02462 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A1P02462 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms