Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA2P01563 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms