Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD1O95696 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD1O95696 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD1O95696 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD1O95696 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD1O95696 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRD1O95696 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRD1O95696 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRD1O95696 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRD1O95696 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRD1O95696 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD1O95696 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD1O95696 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD1O95696 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD1O95696 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD1O95696 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD1O95696 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD1O95696 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD1O95696 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD1O95696 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD1O95696 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD1O95696 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD1O95696 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD1O95696 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD1O95696 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD1O95696 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD1O95696 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD1O95696 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD1O95696 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD1O95696 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD1O95696 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD1O95696 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD1O95696 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD1O95696 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD1O95696 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD1O95696 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD1O95696 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD1O95696 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD1O95696 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD1O95696 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD1O95696 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD1O95696 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD1O95696 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD1O95696 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD1O95696 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD1O95696 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD1O95696 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD1O95696 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD1O95696 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD1O95696 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD1O95696 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD1O95696 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD1O95696 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD1O95696 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD1O95696 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD1O95696 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD1O95696 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD1O95696 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD1O95696 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD1O95696 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD1O95696 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD1O95696 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD1O95696 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD1O95696 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD1O95696 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD1O95696 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD1O95696 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD1O95696 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD1O95696 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD1O95696 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD1O95696 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD1O95696 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD1O95696 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD1O95696 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD1O95696 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD1O95696 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD1O95696 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms