Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms