Protein–RNA interactions for Protein: O75762

TRPA1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPA1O75762 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPA1O75762 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPA1O75762 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms