Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA10O75578 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms