Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAMP4O75379 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAMP4O75379 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VAMP4O75379 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAMP4O75379 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAMP4O75379 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAMP4O75379 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAMP4O75379 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAMP4O75379 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAMP4O75379 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAMP4O75379 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAMP4O75379 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VAMP4O75379 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAMP4O75379 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAMP4O75379 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAMP4O75379 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAMP4O75379 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms