Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3BO75182 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms