Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIA3O75145 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms