Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
N4BP1O75113 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms