Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSCO60682 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSCO60682 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSCO60682 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSCO60682 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MSCO60682 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MSCO60682 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSCO60682 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MSCO60682 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSCO60682 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSCO60682 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSCO60682 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSCO60682 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSCO60682 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSCO60682 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MSCO60682 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSCO60682 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSCO60682 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSCO60682 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSCO60682 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSCO60682 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSCO60682 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSCO60682 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSCO60682 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSCO60682 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSCO60682 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSCO60682 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSCO60682 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSCO60682 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSCO60682 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSCO60682 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSCO60682 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSCO60682 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSCO60682 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSCO60682 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSCO60682 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSCO60682 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSCO60682 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSCO60682 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSCO60682 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSCO60682 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSCO60682 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSCO60682 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSCO60682 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSCO60682 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSCO60682 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSCO60682 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSCO60682 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSCO60682 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSCO60682 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSCO60682 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSCO60682 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSCO60682 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSCO60682 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MSCO60682 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSCO60682 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSCO60682 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSCO60682 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MSCO60682 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSCO60682 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSCO60682 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSCO60682 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSCO60682 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSCO60682 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSCO60682 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSCO60682 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSCO60682 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSCO60682 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSCO60682 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSCO60682 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MSCO60682 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSCO60682 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSCO60682 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSCO60682 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSCO60682 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms