Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms