Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCO2O43819 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCO2O43819 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCO2O43819 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCO2O43819 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCO2O43819 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCO2O43819 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCO2O43819 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCO2O43819 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCO2O43819 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCO2O43819 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCO2O43819 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCO2O43819 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCO2O43819 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCO2O43819 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCO2O43819 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCO2O43819 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCO2O43819 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCO2O43819 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCO2O43819 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCO2O43819 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCO2O43819 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCO2O43819 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCO2O43819 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCO2O43819 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCO2O43819 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCO2O43819 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCO2O43819 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCO2O43819 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCO2O43819 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCO2O43819 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCO2O43819 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCO2O43819 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCO2O43819 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCO2O43819 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCO2O43819 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCO2O43819 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCO2O43819 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCO2O43819 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCO2O43819 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCO2O43819 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCO2O43819 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCO2O43819 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCO2O43819 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCO2O43819 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms