Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms