Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GATCO43716 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATCO43716 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATCO43716 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms