Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SIPA1L1O43166 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L1O43166 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L1O43166 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L1O43166 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L1O43166 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L1O43166 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L1O43166 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L1O43166 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L1O43166 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L1O43166 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L1O43166 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1L1O43166 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L1O43166 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L1O43166 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L1O43166 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1L1O43166 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms