Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms