Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTPRTO14522 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
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