Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms