Protein–RNA interactions for Protein: J3QLI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLI3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QLI3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QLI3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QLI3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QLI3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QLI3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QLI3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QLI3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QLI3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QLI3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QLI3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QLI3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QLI3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QLI3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QLI3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QLI3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QLI3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QLI3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QLI3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QLI3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QLI3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QLI3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QLI3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QLI3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QLI3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QLI3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QLI3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QLI3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QLI3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QLI3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QLI3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QLI3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QLI3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QLI3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QLI3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QLI3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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