Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DEV8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DEV8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DEV8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DEV8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DEV8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DEV8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms