Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM200CA6NKL6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms