Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMB4A4D0S4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB4A4D0S4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms