Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms