Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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HTR4Q13639 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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HTR4Q13639 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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HTR4Q13639 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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HTR4Q13639 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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HTR4Q13639 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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HTR4Q13639 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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HTR4Q13639 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HTR4Q13639 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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