Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AL355916.1-202ENST00000508827 5103 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 ENAH-204ENST00000366844 13168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SCN11AQ9UI33 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
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