Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
AP5B1Q2VPB7 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms