Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms