Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC093283.1-201ENST00000565306 1075 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC010976.1-205ENST00000596439 1007 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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HOXD10P28358 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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HOXD10P28358 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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HOXD10P28358 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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HOXD10P28358 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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HOXD10P28358 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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HOXD10P28358 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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HOXD10P28358 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 MTND6P1-201ENST00000417434 424 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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