Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 XRCC6-206ENST00000428575 2148 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ALDH1L1-AS2-202ENST00000500525 2236 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SP140L-201ENST00000243810 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC025280.2-201ENST00000625056 2547 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MIR9-3HG-203ENST00000546186 2718 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MTMR11-202ENST00000439741 2827 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 C13orf42-202ENST00000563710 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LPAR3-202ENST00000440886 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ANGEL2-202ENST00000366962 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CXorf36-202ENST00000398000 4655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TATDN2-203ENST00000448281 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 POP4-202ENST00000585603 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TRIM26-266ENST00000437089 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 HKR1-203ENST00000541583 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TCF4-226ENST00000565018 2357 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TARDBP-230ENST00000639083 2269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RPL22L1-201ENST00000295830 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 GNPDA2-203ENST00000507917 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CD300LF-203ENST00000343125 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 METTL1-201ENST00000257848 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 IGLV3-27-201ENST00000390304 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CCDC134-202ENST00000402061 525 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TRIB2-203ENST00000405331 830 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TAC3-205ENST00000415231 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 Z93930.2-205ENST00000422972 409 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NDUFA3P3-201ENST00000423475 250 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MTPN-202ENST00000435723 879 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 FDPSP8-201ENST00000438304 1089 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ATP5J2LP-201ENST00000444161 235 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC009229.1-201ENST00000450854 622 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL133264.2-201ENST00000453179 555 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LAMTOR4-203ENST00000460732 616 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL581P-201ENST00000477181 309 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC016868.1-201ENST00000521725 523 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 PLA2G1B-203ENST00000549767 562 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC079907.2-201ENST00000550307 1034 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ZFHX2-AS1-203ENST00000556354 931 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RPL7AP66-201ENST00000588490 801 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL670729.2-201ENST00000602963 480 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC006238.1-201ENST00000609787 534 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 KDM5DP1-201ENST00000622542 298 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LINC01176-202ENST00000628121 716 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CYB561A3-202ENST00000426130 3205 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 FCHO1-216ENST00000596536 3204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 PHF8-201ENST00000322659 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 HLA-F-AS1-209ENST00000458236 2835 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 PAX6-259ENST00000639916 2622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ACOX2-202ENST00000459701 2348 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LRRTM4-204ENST00000409884 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MTMR10-202ENST00000563714 2216 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 EXOC1-203ENST00000381295 3551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NET1-202ENST00000380359 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC128688.2-201ENST00000563632 1937 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TTC27-201ENST00000317907 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SGCG-201ENST00000218867 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 GPR55-201ENST00000392039 1523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC009831.2-201ENST00000581802 1441 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TCL6-207ENST00000483087 2194 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MIGA1-202ENST00000443751 6409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 WWP2-213ENST00000568684 3672 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 OR11A1-203ENST00000377149 2611 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NOL6-204ENST00000379471 3843 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CMKLR1-202ENST00000412676 5110 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LIPC-AS1-201ENST00000561083 2231 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ZNF215-201ENST00000278319 3448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ABLIM3-205ENST00000504238 2774 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SOX5-215ENST00000545921 2589 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 GOLT1A-201ENST00000308302 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL450998.1-201ENST00000321418 438 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms