Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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CDH18Q13634 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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