Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
COG3Q96JB2 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms