Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 DRP2-205ENST00000541709 6835 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 ADAM22-205ENST00000398209 9144 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AL512590.3-202ENST00000534123 6463 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 ADGRL3-213ENST00000509896 5069 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 FAM199X-202ENST00000493442 7457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 ZHX3-218ENST00000560364 4283 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 ZSWIM5P3-201ENST00000511265 2743 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 KCNMA1-273ENST00000639913 12071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms