Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC61Q9Y6R9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC61Q9Y6R9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms