Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms