Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q8

GTF3C5, General transcription factor 3C polypeptide 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5Q9Y5Q8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C5Q9Y5Q8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF3C5Q9Y5Q8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF3C5Q9Y5Q8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C5Q9Y5Q8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C5Q9Y5Q8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C5Q9Y5Q8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C5Q9Y5Q8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C5Q9Y5Q8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C5Q9Y5Q8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C5Q9Y5Q8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C5Q9Y5Q8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms