Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNSTRNQ9Y448 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
KNSTRNQ9Y448 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KNSTRNQ9Y448 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KNSTRNQ9Y448 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KNSTRNQ9Y448 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KNSTRNQ9Y448 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KNSTRNQ9Y448 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KNSTRNQ9Y448 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KNSTRNQ9Y448 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KNSTRNQ9Y448 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KNSTRNQ9Y448 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KNSTRNQ9Y448 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KNSTRNQ9Y448 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KNSTRNQ9Y448 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KNSTRNQ9Y448 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms