Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL11Q9Y3B7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL11Q9Y3B7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms