Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHDC2Q9Y2U9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms