Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR55Q9Y2T6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms