Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAN1Q9Y2M0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms