Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIAA1024Q9UPX6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms