Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRQQ9UMZ3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms