Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms