Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms